zhrosЗерновое хозяйство РоссииGrain Economy of Russia2079-87252079-8733Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Аграрный научный центр "Донской»10.31367/2079-8725-2020-67-1-69-71zhros-871Research ArticleСЕЛЕКЦИЯ И СЕМЕНОВОДСТВО СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ РАСТЕНИЙPLANT BREEDING AND SEED PRODUCTION OF AGRICULTURAL CROPSОценка стабильности ДНК-содержащих растительных образцов, хранившихся в условиях ускоренной деградации ДНКEstimation of stability of DNA-containing vegetable samples stored under the accelerated DNA degradationhttps://orcid.org/0000-0002-0144-8822ХачумовВ. А.KhachumovV. A.

Аспирант.

344090, Ростов-на-Дону, пр. Стачки, 194/1.

Post graduate.

344090 Rostov-on-Don, Stachki Av., 194/1.

VladimirKhachumov@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0274-3302КорниенкоИ. В.KornienkoI. V.

Доктор биологических наук.

344090, Ростов-на-Дону, пр. Стачки, 194/1.

Doctor of Biological Sciences.

344090 Rostov-on-Don, Stachki Av., 194/1.

VladimirKhachumov@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0600-7927УсатовА. В.UsatovA. V.

Доктор биологических наук, профессор.

344090, Ростов-на-Дону, пр. Стачки, 194/1.

Doctor of Biological Sciences, professor.

344090 Rostov-on-Don, Stachki Av., 194/1.

VladimirKhachumov@yandex.ruАкадемия биологии и биотехнологии, Южный федеральный университетРоссияAcademy of biology and biotechnology, the Southern Federal UniversityRussian Federation202007042020016971Copyright © Хачумов В.А., Корниенко И.В., Усатов А.В., 20202020Хачумов В.А., Корниенко И.В., Усатов А.В.Khachumov V.A., Kornienko I.V., Usatov A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.zhros.online/jour/article/view/871

Проведена оценка стабильности ДНК-содержащих растительных образцов, хранившихся в условиях, моделирующих ускоренную деградацию ДНК. Материалом исследования служили культурные линии H. annuus (ВИР 114, ВИР 116) и дикорастущие формы подсолнечника H. decapetalus, H. petiolaris, H. rigidus из коллекции Всероссийского института генетических ресурсов растений им. Н. И. Вавилова. В среднем уровень стабильности длинных фрагментов ДНК для ядерного, митохондриального и хлоропластного геномов относительно контроля составил 76,9; 87,5 и 98,3% соответственно. При оценке стабильности коротких фрагментов ДНК было показано, что количество ядерной, митохондриальной и хлоропластной ДНК относительно контроля в среднем составило 89,5; 96,0 и 97,7% соответственно.

There has been carried out an estimation of stability of DNA-containing plant samples stored under the conditions that model accelerated DNA degradation. The research material were the lines H. annuus (“VIR 114”, “VIR 116”) and wild-growing forms of sunflower H. decapetalus, H. petiolaris, H. rigidus taken from the collection of the N. I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources. On average, the stability level of long DNA fragments for the nuclear, mitochondrial, and chloroplast genomes was 76.9%, 87.5%, and 98.3% respectively compared with the control. When assessing the stability of short DNA fragments, it was shown that on average, the number of nuclear, mitochondrial, and chloroplast DNA was 89.5%, 96.0%, and 97.7% respectively compared with the control.

длительное хранение ДНКДНК растенийДНК банкигенетические коллекцииlong-term DNA storageDNA of plantsDNA banksgenetic collectionsРабота выполнена при поддержке фонда содействия инновациям (проект № 8795ГУ/2015).ReferencesСпособ хранения ДНК-содержащего растительного материала в широком диапазоне температур: пат. 2703058 Российская Федерация. № 2017143012/10; заявл. 08.12.2017; опубл. 15.10.2019; бюл. № 29.Sposob hraneniya DNK-soderzhashchego rastitel’nogo materiala v shirokom diapazone temperature [A method of storing DNA-containing plant material in a wide temperature range]: pat. 2703058 Rossijskaya Federaciya. № 2017143012/10; zayavl. 08.12.2017; opubl. 15.10.2019; byul. № 29.Dormontt E. et al. Advancing DNA barcoding and metabarcoding applications for plants requires systematic analysis of herbarium collections-an Australian perspective. 2018. Vol. 6. DOI: 10.3389/fevo.2018.00134.Dormontt E. et al. Advancing DNA barcoding and metabarcoding applications for plants requires systematic analysis of herbarium collections-an Australian perspective. 2018. Vol. 6. DOI: 10.3389/fevo.2018.00134.Fiona R. Hay et al. Advances in seed conservation of wild plant species: a review of recent research // Conservation Physiology. 2013 Vol. 1(1). cot030. DOI: 10.1093/conphys/cot030.Fiona R. Hay et al. Advances in seed conservation of wild plant species: a review of recent research // Conservation Physiology. 2013 Vol. 1(1). cot030. DOI: 10.1093/conphys/cot030.Liu U. et al. The conservation value of germplasm stored at the millennium seed bank, royal botanic gardens, Kew, UK // Biodiversity and conservation. 2018. Vol. 27(6). Pp. 1347–1386. DOI: 10.1007/s10531-018-1497-y.Liu U. et al. The conservation value of germplasm stored at the millennium seed bank, royal botanic gardens, Kew, UK // Biodiversity and conservation. 2018. Vol. 27(6). Pp. 1347–1386. DOI: 10.1007/s10531-018-1497-y.Livak K. J., Schmittgen T. D. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2−ΔΔCT method // Methods. 2001. Vol. 25(4). Pp. 402–408. DOI: 10.1006/meth.2001.1262.Livak K. J., Schmittgen T. D. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2−ΔΔCT method // Methods. 2001. Vol. 25(4). Pp. 402–408. DOI: 10.1006/meth.2001.1262.Usatov A. V., Kostylev K. V., Azarin N. V. et al. Introgression of the rice blast resistance genes Pi1, Pi2 and Pi33 into Russian rice varieties by marker-assisted selection // Indian Journal of Genetics and Plant Breeding. 2016. Vol. 76(1). Pp. 18–23. DOI: 10.5958/0975-6906.2016.00003.1.Usatov A. V., Kostylev K. V., Azarin N. V. et al. Introgression of the rice blast resistance genes Pi1, Pi2 and Pi33 into Russian rice varieties by marker-assisted selection // Indian Journal of Genetics and Plant Breeding. 2016. Vol. 76(1). Pp. 18–23. DOI: 10.5958/0975-6906.2016.00003.1.Yu X. et al. Genomic prediction contributing to a promising global strategy to turbocharge gene banks // Nature Plants. 2016. Vol. 2(10). 16150. DOI: 10.1038/NPLANTS.2016.150.Yu X. et al. Genomic prediction contributing to a promising global strategy to turbocharge gene banks // Nature Plants. 2016. Vol. 2(10). 16150. DOI: 10.1038/NPLANTS.2016.150.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.