<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">zhros</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Зерновое хозяйство России</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Grain Economy of Russia</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2079-8725</issn><issn pub-type="epub">2079-8733</issn><publisher><publisher-name>Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Аграрный научный центр "Донской»</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.31367/2079-8725-2022-82-5-15-19</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">zhros-2041</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>СЕЛЕКЦИЯ И СЕМЕНОВОДСТВО СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ РАСТЕНИЙ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>PLANT BREEDING AND SEED PRODUCTION OF AGRICULTURAL CROPS</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Определение аллельного состояния гена толерантности к затоплению (Sub-1A) в селекционных образцах риса</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Identification of the allelic state of the flood tolerance gene (Sub-1A) in rice breeding samples</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-2046-4000</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Вожжова</surname><given-names>Н. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vozhzhova</surname><given-names>N. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>кандидат сельскохозяйственных наук, старший научный сотрудник лаборатории клеточной селекции</p><p>347740, Ростовская обл., г. Зерноград, Научный городок, 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Candidate of Agricultural Sciences, senior researcher of the laboratory for cell breeding</p><p>347740, Rostov region, Zernograd, Nauchny Gorodok, 3</p></bio><email xlink:type="simple">nvozhzh@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-1477-3285</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Жогалева</surname><given-names>О. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zhogaleva</surname><given-names>O. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник лаборатории клеточной селекции</p><p>347740, Ростовская обл., г. Зерноград, Научный городок, 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>junior researcher of the laboratory for cell breeding</p><p>347740, Rostov region, Zernograd, Nauchny Gorodok, 3</p></bio><email xlink:type="simple">os.zogaleva@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1432-7616</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Дубина</surname><given-names>А. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Dubina</surname><given-names>A. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>техник-исследователь лаборатории клеточной селекции</p><p>347740, Ростовская обл., г. Зерноград, Научный городок, 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>research technician of the laboratory for cell breeding</p><p>347740, Rostov region, Zernograd, Nauchny Gorodok, 3</p></bio><email xlink:type="simple">angel.myshastaja@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4371-6848</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Костылев</surname><given-names>П. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kostylev</surname><given-names>P. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>доктор сельскохозяйственных наук, профессор, главный научный сотрудник лаборатории селекции и семеноводства риса</p><p>347740, Ростовская обл., г. Зерноград, Научный городок, 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Doctor of Agricultural Sciences, professor, main researcher of the laboratory for rice breeding and seed production</p><p>347740, Rostov region, Zernograd, Nauchny Gorodok, 3</p></bio><email xlink:type="simple">p-kostylev@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБНУ «Аграрный научный центр «Донской»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>FSBSI “Agricultural Research Center “Donskoy”</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2022</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>16</day><month>11</month><year>2022</year></pub-date><volume>0</volume><issue>5</issue><fpage>15</fpage><lpage>19</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Вожжова Н.Н., Жогалева О.С., Дубина А.Ю., Костылев П.И., 2022</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Вожжова Н.Н., Жогалева О.С., Дубина А.Ю., Костылев П.И.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Vozhzhova N.N., Zhogaleva O.S., Dubina A.Y., Kostylev P.I.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.zhros.online/jour/article/view/2041">https://www.zhros.online/jour/article/view/2041</self-uri><abstract><p>Культура риса относится к важнейшим сельскохозяйственным растениям мирового производства. Урожаи риса обеспечивают питанием большое количество жителей регионов Азии и Тихого океана. В России производство этой культуры сосредоточено в нескольких регионах, к одному из которых относится Ростовская область. Тренд на экологизацию земледелия во всем мире и России становится все более устойчивым. Для борьбы с сорными растениями по экологичной безгербицидной технологии необходимо увеличение слоя воды при одновременном выживании растений риса. Чтобы такая стратегия срабатывала, необходимо создание сортов, устойчивых к затоплению. Целью нашего исследования являлось определение аллельного состояния гена устойчивости к затоплению Sub1A в селекционных образцах риса. Объект исследования – 90 образцов риса шестого поколения, выделенных из гибридов от скрещивания российских сортов с сортами-донорами гена. Анализ проводился следующими методами: выделения ДНК коммерческим набором «ДНК-Экстран-3» (Синтол, Россия), постановки классической ПЦР со специализированным диагностическим маркером Sub1A203, разделения ампликонов электрофорезом в 2 % агарозных гелях, анализа электрофореграмм в программном обеспечении Bio-Rad ImageLab 6.0.1. В результате проведенных анализов было идентифицировано аллельное состояние гена Sub1A у 90 образцов риса. Значительное количество образцов несло нефункциональный рецессивный аллель, у 19 образцов наличие гена не было установлено. В гетерозиготном состоянии ген Sub1A находился у 9 образцов. У 5 селекционных образцов идентифицировано наличие функционального доминантного аллеля целевого гена. Рекомендуется использование данных образцов в селекционной работе, направленной на создание новых сортов риса, устойчивых к длительному затоплению.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Rice is one of the most important crops in the world. Rice crops provide food for many people in Asia and the Pacific. In Russia, the production of this crop is concentrated in several regions, one of which is the Rostov region. The trend towards the greening of agriculture throughout the world and in Russia is becoming more and more stable. In order to combat weeds using an environmentally friendly herbicide-free technology, it is necessary to increase the water layer on simultaneous surviving rice plants. For such a strategy to work, it is necessary to develop varieties that are resistant to flooding. The purpose of the current study was to identify the allelic state of the Sub1A flood resistance gene in breeding rice samples. The objects of the study were 90 rice samples of the sixth generation, identified in hybrids obtained from crossing Russian varieties with gene donor varieties. The analysis was carried out by such methods as DNA extraction using the “DNA-Extran-3” commercial kit (Sintol, Russia), classical PCR with the specialized diagnostic marker Sub1A203, separation of amplicons by electrophoresis in 2 % agarose gels, analysis of electrophoregrams in the software Bio-Rad ImageLab 6.0.1. As a result of the analysis, there was identified the allelic state of the Sub1A gene in 90 rice samples. A significant number of samples carried a non-functional recessive allele, the presence of the gene was not established in 19 samples. The Sub1A gene was in the heterozygous state in 9 samples. The presence of a functional dominant allele of the target gene was identified n 5 breeding samples. There has been recommended to use these samples in breeding work aimed at developing new rice varieties resistant to prolonged flooding.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>Sub-1</kwd><kwd>затопление</kwd><kwd>ген устойчивости</kwd><kwd>селекционные образцы</kwd><kwd>рис</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Sub-1</kwd><kwd>flooding</kwd><kwd>resistance gene</kwd><kwd>selection samples</kwd><kwd>rice</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Силаева Л. П., Полутина Т. Н. Специализированные зоны производства риса // Вестник Курской государственной сельскохозяйственной академии. 2018. № 7. С. 172–177. EDN PIQNTD.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Silaeva L. P., Polutina T. N. Spetsializirovannye zony proizvodstva risa [Specialized rice production zones] // Vestnik Kurskoi gosudarstvennoi sel'skokhozyaistvennoi akademii. 2018. № 7. S. 172–177. EDN PIQNTD.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ковальчук А. П., Милорадов К. А. Производство чистых продуктов в условиях экологизации аграрного сектора экономики // Продовольственная политика и безопасность. 2021. Т. 8, № 3. С. 249–262. DOI: 10.18334/ppib.8.3.112312. EDN DAFZNC.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Koval'chuk A. P., Miloradov K. A. Proizvodstvo chistykh produktov v usloviyakh ekologizatsii agrarnogo sektora ekonomiki [Production of clean products in the conditions of greening the «Agricultural sector of the economy] // Prodovol'stvennaya politika i bezopasnost'. 2021. T. 8, № 3. S. 249–262. DOI: 10.18334/ppib.8.3.112312. EDN DAFZNC.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Murray M. G., Thompson W. F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA // Nucleic Acids Res. 1980. Vol. 8. P. 4321–4325. DOI: 10.1093/nar/8.19.4321.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Murray M. G., Thompson W. F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA // Nucleic Acids Res. 1980. Vol. 8. P. 4321–4325. DOI: 10.1093/nar/8.19.4321.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Oladosu Y., Rafii M. Y., Arolu F., Chukwu S. C., Muhammad I., Kareem I., Salisu M. A., Arolu I. W. Submergence tolerance in rice: Review of mechanism, breeding and, future prospects. // Sustainability. 2020. Vol. 12. P. 1632. DOI: 10.3390/su12041632.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Oladosu Y., Rafii M. Y., Arolu F., Chukwu S. C., Muhammad I., Kareem I., Salisu M.мA., Arolu I. W. Submergence tolerance in rice: Review of mechanism, breeding and, future prospects. // Sustainability. 2020. Vol. 12. P. 1632. DOI: 10.3390/su12041632.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Panda D., Barik J. Flooding Tolerance in Rice: Focus on Mechanisms and Approaches // Rice Science. Vol. 28, Is. 1. 2021. P. 43–57. DOI: 10.1016/j.rsci.2020.11.006.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Panda D., Barik J. Flooding Tolerance in Rice: Focus on Mechanisms and Approaches // Rice Science. Vol. 28. I. 1. 2021. P. 43–57. https://doi.org/10.1016/j.rsci.2020.11.006.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Xu K., Xu X., Fukao T., Canlas P., Maghirang-Rodriguez R., Heuer S., Ismail A. M., Bailey-Serres J., Ronald P. C., Mackill D. J. Sub1A is an ethylene-response-factor-like gene that confers submergence tolerance to rice // Nature. 2006. Vol. 442, Is. 7103. P. 705–708.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Xu K., Xu X., Fukao T., Canlas P., Maghirang-Rodriguez R., Heuer S., Ismail A. M., Bailey-Serres J., Ronald P. C., Mackill D. J. Sub1A is an ethylene-response-factor-like gene that confers submergence tolerance to rice // Nature. 2006. Vol. 442, Is. 7103. P. 705–708.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Septiningsih E. M., Pamplona A. M., Sanchez D. L., Neeraja C. N., Vergara G. V., Heuer S., Ismail A. M., Mackill D. J. Development of submergence-tolerant rice cultivars: the Sub1 locus and beyond // Ann. Bot. 2009. Vol. 103. P. 151–160. DOI: 10.1093/aob/mcn206.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Septiningsih E. M., Pamplona A. M., Sanchez D. L., Neeraja C. N., Vergara G. V., Heuer S., Ismail A. M., Mackill D. J. Development of submergence-tolerant rice cultivars: the Sub1 locus and beyond // Ann. Bot. 2009. Vol. 103. P. 151–160. DOI: 10.1093/aob/mcn206.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
